La relation génotype-phénotype: des approches réductionnistes aux approches holistiques basées sur la protéomique

La relation génotype-phénotype: des approches réductionnistes aux approches holistiques basées sur la protéomique

Soutenance de HDR
 04/12/2025
 13:00:00
 Mélisande BLEIN-NICOLAS, GQE-Le Moulon
 IDEEV - Salle Rosalind Franklin

Résumé

L’étude de la relation génotype-phénotype vise à comprendre comment des variations génétiques entre individus se traduisent en différences observables au niveau des caractères phénotypiques. Cette relation est particulièrement complexe car elle fait intervenir différents niveaux d’organisation moléculaires étroitement interconnectés et soumis à de multiples facteurs. Depuis le début de ma carrière, je m’attache à comprendre comment se construit la relation génotype-phénotype, en particulier chez les plantes cultivées.

Dans un premier temps, j’ai abordé cette question à travers l’étude des mécanismes de l’immunité chez les céréales, en mobilisant des approches de biologie moléculaire. Mon arrivée sur la plateforme de protéomique PAPPSO, en 2010, m’a ensuite amenée à m’orienter vers des approches plus holistiques, reposant notamment sur l’intégration de données multi-omiques. Mes travaux, menés dans un cadre collaboratif et pluri-disciplinaire, ont ainsi contribué à mieux comprendre les manifestations de l’hétérosis chez la levure et les bases génétiques et moléculaires de la réponse à la sécheresse chez le maïs. En parallèle, j’ai également contribué à des développements méthodologiques dans le domaine de la protéomique, dans l’objectif d’améliorer le traitement des données et de pouvoir mettre en oeuvre de nouvelles approches pour l’étude de la relation génotype-phénotype.

Composition du jury

  • Maria Manzanarès-Dauleux, Professeure, Institut Agro Rennes (rapportrice)
  • Nathalie Vialaneix, Directrice de Recherche, INRAE (rapportrice)
  • David Pot Directeur de Recherche, CIRAD (rapporteur)
  • Karine Gallardo-Guerrero, Directrice de Recherche, INRAE (examinatrice)
  • Thomas BURGER, Directeur de Recherche, CNRS (examinateur)
  • Karine Alix, Professeure, AgroParisTech (examinatrice)

Cette soutenance peut être suivie en visio : https://visio.numerique.gouv.fr/sad-calc-whe