PAPPSO rejoint l’infrastructure nationale en protéomique ProFI

 23/06/2026

Au terme d’un processus d’élargissement visant à intégrer de nouvelles expertises, l’infrastructure nationale en protéomique ProFI intègre la plateforme PAPPSO au 1er janvier 2026.

ProFI   (ou ProFI Proteomics), l’une des 27 infrastructures nationales en biologie santé (INBS) inscrites sur la feuille de route du Ministère de l’enseignement supérieur, de la recherche et de l’espace, se consacre au développement d’outils et de méthodes innovantes pour une caractérisation de plus en plus fine et exhaustive des protéines dans les systèmes biologiques. ProFI a également une double mission pour la communauté scientifique : 1) Offrir des services d’analyse protéomique de haute qualité aux secteurs académiques et privés ; 2) former et partager les savoir-faire et les outils informatiques qu’elle développe. ProFI comporte désormais 8 plateformes membres labelisées IBiSA proposant des services et développements de pointe en protéomique.

PAPPSO   vient enrichir ProFI par son expertise historique en protéomique végétale, microbienne et animale, en métaprotéomique humaine et en peptidomique. Elle vient également renforcer les capacités de ProFI en terme de développement bioinformatique. Cette intégration marque une véritable reconnaissance pour PAPPSO. Elle représente également de nouvelles opportunités de collaboration vers des développements innovants en protéomique et ouvre la voie à des appels d’offre réservés aux infrastructures nationales.

L’objectif de la Plateforme d’Analyse Protéomique de Paris Sud-Ouest (PAPPSO)   est de mettre à disposition des équipes qui s’adressent à elle un équipement, une compétence scientifique et un savoir-faire adaptés aux questions posées, depuis les plus simples (identification de protéines provenant d’un organisme entièrement séquencé) jusqu’aux plus complexes (quantification relative ou semi-absolue des variations, dynamique des modifications post-traductionnelles,…), dans le cadre de collaborations et de prestations. PAPPSO réunit deux plateaux techniques complémentaires. L’un, adossé à l’UMR Génétique Quantitative et Evolution - Le Moulon (Gif-sur-Yvette), est spécialisé dans la biologie végétale (espèces modèles et cultivées), et l’autre, adossé à l’UMR Microbiologie de l’Alimentation au service de la Santé (MICALIS, Jouy-en-Josas), est spécialisé en microbiologie, biologie animale (modèles bovin, murin) et, plus ponctuellement, en biologie humaine. Ses équipements de toute dernière génération permettent à PAPPSO de proposer la réalisation d’analyses par spectrométrie de masse, avec ou sans pré-fractionnement des protéines ou des peptides, et avec ou sans marquage isotopique. PAPPSO s’est spécialisée dans le haut débit (analyse quantitative de cohortes de grande taille), dans l’analyse d’échantillons très complexes (métaprotéomique), et dans la peptidomique. Elle développe les outils de bioinformatique et d’analyse de données qui permettent de traiter ce type d’expérience, et accompagne les utilisateurs dans l’interprétation de leurs données.

Contact : Mélisande Blein-Nicolas ( melisande.blein-nicolas@inrae.fr ), Céline Henry ( celine.henry@inrae.fr )