GEE - Génétique et Écologie Évolutives
01/01/0001 -
ESE
L’équipe de recherche Génétique et Écologie Évolutives (GEE) développe des thématiques de recherche en génétique, génomique, écologie et évolution. Nous nous intéressons à l’écologie et à l’évolution des champignons, des bactéries, des insectes, des plantes et des oiseaux, aux interactions entre espèces (notamment hôtes-parasites) et à la génomique évolutive de l’adaptation.
Responsable :
Tatiana Giraud (CNRS)
Responsable :
Tatiana Giraud (CNRS)
L’équipe de recherche Génétique et Écologie Évolutives (GEE) développe des thématiques de recherche en génétique, génomique, écologie et évolution. Nous nous intéressons à l’écologie et à l’évolution des champignons, des bactéries, des insectes, des plantes et des oiseaux, aux interactions entre espèces (notamment hôtes-parasites) et à la génomique évolutive de l’adaptation.
Nous cherchons à comprendre l’adaptation des espèces et des populations à leur environnement, et à identifier les gènes et mécanismes impliqués. Nos modèles biologiques sont les champignons pathogènes de plantes, les champignons (notamment Penicillium) domestiqués du fromage et des charcuteries, les bactéries pathogènes de l’Homme (Mycobacterium tuberculosis), les pommiers cultivés, Arabidopsis et ses parasites, ainsi que les oiseaux et leurs microbes associés.
Membres
- Tatiana Giraud, DR CNRS (CNRS)
- Juergen Kroymann, Directeur de Recherche (CNRS)
- Amandine Labat, Tech Agro Paris Tech (AgroParisTech)
- Anders moller, chercheur (CNRS)
- Ricardo Rodriguez de la Vega, IR CNRS (CNRS)
- Jeanne Ropars, CR CNRS (CNRS)
- Jacqui Shykoff, Directeur de Recherche (CNRS)
- Alodie Snirc, IE CNRS (CNRS)
Publications
2024- Ament-Velásquez SL., Vogan AA., Wallerman O., Hartmann FE., Gautier V., Silar P., Giraud T. , Johannesson H., Ma LJ.. (2024) High-Quality Genome Assemblies of 4 Members of the Podospora anserina Species Complex. Genome Biology and Evolution, 3 (16) evae034
- Fountain‐Jones NM., Giraud T. , Zinger L., Bik H., Creer S., Videvall E.. (2024) Molecular ecology of microbiomes in the wild: Common pitfalls, methodological advances and future directions. Molecular Ecology, 2 (33) e17223
- Jay P., Jeffries D., Hartmann FE., Véber A., Giraud T. . (2024) Why do sex chromosomes progressively lose recombination?. Trends Genet, 7 (40) 564-579
- Lucotte EA., Jay P., Rougemont Q., Boyer L., Cornille AA., Snirc A. , Labat A. , Chahine E., Duhamel M., Gendelman J., Ma WJ., Hayes RK., Perlin MH., Hood M., Rodriguez de la Vega R. , Giraud T. . (2024) Repeated loss of function at HD mating-type genes and of recombination suppression without mating-type locus linkage in anther-smut fungi. bioRxiv, 2024.03.03.583181
- Timmis K., Hallsworth JE., McGenity TJ., Armstrong R., Colom MF., Karahan ZC., Chavarría M., Bernal P., Boyd ES., Ramos JL., Kaltenpoth M., Pruzzo C., Clarke G., López‐Garcia P., Yakimov MM., Perlmutter J., Greening C., Eloe‐Fadrosh E., Verstraete W., Nunes OC., Kotsyurbenko O., Nikel PI., Scavone P., Häggblom MM., Lavigne R., Le Roux F., Timmis JK., Parro V., Michán C., García JL., Casadevall A., Payne SM., Frey J., Koren O., Prosser JI., Lahti L., Lal R., Anand S., Sood U., Offre P., Bryce CC., Mswaka AY., Jores J., Kaçar B., Blank LM., Maaßen N., Pope PB., Banciu HL., Armitage J., Lee SY., Wang F., Makhalanyane TP., Gilbert JA., Wood TK., Vasiljevic B., Soberón M., Udaondo Z., Rojo F., Tamang JP., Giraud T. , Ropars J. , Ezeji T., Müller V., Danbara H., Averhoff B., Sessitsch A., Partida‐Martínez LP., Huang W., Molin S., Junier P., Amils R., Wu XL., Ron E., Erten H., De Martinis ECP., Rapoport A., Öpik M., Pokatong WDR., Stairs C., Amoozegar MA., Serna JG.. (2024) A concept for international societally relevant microbiology education and microbiology knowledge promulgation in society. Microbial Biotechnology, 5 (17) e14456
- Crequer E., Ropars J. , Jany JL., Caron T., Coton M., Snirc A. , Vernadet JP., Branca A., Giraud T. , Coton E.. (2023) A new cheese population in Penicillium roqueforti and adaptation of the five populations to their ecological niche. Evolutionary Applications, 8 (16) 1438-1457
- Jay P., Tezenas E., Véber A., Giraud T. , Hurst LD.. (2022) Sheltering of deleterious mutations explains the stepwise extension of recombination suppression on sex chromosomes and other supergenes. PLoS Biol, 7 (20) e3001698