
Dominique DE VIENNE
dernières mises à jour 07/07/2018
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dominique.de-vienne@inrae.fr
Biologie de l'Adaptation et Systèmes en Évolution
UPSay, Professeur
publications - orcid
Fonctions
- Professeur émérite à l’Université Paris-Saclay depuis 2017.
- Professeur à l’Université Paris-Sud de 1990 à 2017.
- Directeur de recherche à l’INRA de 1988 à 1999.
Responsabilités
- Directeur de l’UMR de génétique végétale (INRA, Université Paris-Sud, CNRS, AgroParisTech) à Gif-sur-Yvette (1999–2014)
- Membre du conseil scientifique de l’Ecole doctorale Gènes, Génomes, Cellules, devenue l’Ecole doctorale Struture et Dynamique des Systèmes Vivants, de l’Université Paris-Saclay (2000–2022).
- Membre de nombreux jurys et comités de recrutement pour l’Université Paris-Sud, le CNRS, l’INRA, l’IRD, l’IFREMER, de comités d’évaluation de laboratoires (AERES et HCERES).
Thèmes de recherche
La question qui sous-tend toutes mes recherches est celle de la relation entre la variation génotypique et la variation phénotypique, à divers niveaux d’organisation du vivant. Mes premiers travaux portaient sur la réponse du maïs au défcit hydrique, et s’appuyaient sur l’utilisation du marqueage moléculaire et de la protéomique quantitative. Mon équipe a joué un rôle pionnier dans ce domaine en montrant comment cartographier les gènes qui contrôlent les abondances des protéines (Protein Quantity Loci, ou pQTL). Mes recherches actuelles portent sur la modélisation de la variation quantitative, par une approche de biologie des systèmes fondée notamment sur la MCA (Metabolic Control Analysis). Dans ce contexte, j’ai analysé : (1) les bases de l’hétérosis, un phénomène majeur pour la sélection animale et végétale, (2) l’évolution des concentrations d’enzymes lorsqu’il y a sélection directionnelle sur les flux métaboliques, (3) les conséquences génétiques de la non-linéarité de la relation entre le génotype et les niveaux phénotypiques successifs.
Enseignements
- Génétique quantitative
- Evolution des eucaryotes
- Modélisation du métabolism.
Publications
2023
- Coton C., Dillmann C., de Vienne D. . (2023) Evolution of enzyme levels in metabolic pathways: A theoretical approach. Part 2. Journal of Theoretical Biology, (558) 111354
2022
- Coton C., Talbot G., Le Louarn M., Dillmann C., de Vienne D. . (2022) Evolution of enzyme levels in metabolic pathways: A theoretical approach. Part 1. Journal of Theoretical Biology, (538) 111015
- de Vienne D. , Capy P.. (2022) Special issue on “The relationship between genotype and phenotype: new insight into an old question”. Genetica, 3-4 (150) 151-151
- de Vienne D. . (2022) What is a phenotype? History and new developments of the concept. Genetica, 3-4 (150) 153-158
2021
- Petrizzelli MS., de Vienne D. , Nidelet T., Noûs C., Dillmann C., Kaleta C.. (2021) Data integration uncovers the metabolic bases of phenotypic variation in yeast. PLoS Comput Biol, 7 (17) e1009157
2020
- de Vienne D. , Fiévet JB.. (2020) The Pitfalls of Heterosis Coefficients. Plants, 7 (9) 875
2019
- Petrizzelli M., de Vienne D. , Dillmann C.. (2019) Decoupling the Variances of Heterosis and Inbreeding Effects Is Evidenced in Yeast's Life-History and Proteomic Traits. Genetics, 2 (211) 741-756
- Petrizzelli M., 8 juillet 2019, Mathematical modelling and integration of complex biological data: analysis of the heterosis phenomenon in yeas, PhD Thesis, Université Paris-Saclay
- Vasseur F., Fouqueau L., de Vienne D. , Nidelet T., Violle C., Weigel D.. (2019) Nonlinear phenotypic variation uncovers the emergence of heterosis in Arabidopsis thaliana. PLoS Biol, 4 (17) e3000214
2018
- Fiévet JB., Nidelet T., Dillmann C., de Vienne D. . (2018) Heterosis Is a Systemic Property Emerging From Non-linear Genotype-Phenotype Relationships: Evidence From in Vitro Genetics and Computer Simulations. Front. Genet., (9)
2016
- Sabarly V., Aubron C., Glodt J., Balliau T., Langella O., Chevret D., Rigal O., Bourgais A., Picard B., de Vienne D. , Denamur E., Bouvet O., Dillmann C.. (2016) Interactions between genotype and environment drive the metabolic phenotype within Escherichia coli isolates. Environmental microbiology, 1 (18) 100-17
2013
- Albertin W., Marullo P., Bely M., Aigle M., Bourgais A., Langella O., Balliau T., Chevret D., Valot B., da Silva T., Dillmann C., de Vienne D. , Sicard D.. (2013) Linking post-translational modifications and variation of phenotypic traits. Molecular & cellular proteomics : MCP, 3 (12) 720-35
- Albertin W., da Silva T., Rigoulet M., Salin B., Masneuf-Pomarede I., de Vienne D. , Sicard D., Bely M., Marullo P.. (2013) The mitochondrial genome impacts respiration but not fermentation in interspecific Saccharomyces hybrids. PloS one, 9 (8) e75121
- Blein-Nicolas M., Albertin W., Valot B., Marullo P., Sicard D., Giraud C., Huet S., Bourgais A., Dillmann C., de Vienne D. , Zivy M.. (2013) Yeast proteome variations reveal different adaptive responses to grape must fermentation. Molecular biology and evolution, 6 (30) 1368-83